KURAZONE ~ Kurshima Takatora terus menyiapkan Proyek Ark, yang bertujuan untuk keselamatan umat manusia dengan mengorbankan banyak nyawa. Sementara itu, para Kurokage Troopers Yggdrasill sedang diserang oleh Armored Rider tidak dikenal. Akatsuki Toka, pelayan yang dulu dipekerjakan oleh keluarga Kureshima, muncul dan bernostalgia setelah tidak bertemu selama 6 tahun dengan Takatora, penyeranganpun berlangsung yang diawali terluka parahnya Sid oleh Armored Rider tak dikenal ini yang bisa mengendalikan Crack.
Kaito Kumon terus melakukan pencarian Overlord setelah sepakat dengan Sengoku Ryoma. Dengan Tujuan: menjadi lebih kuat. Sementara itu, ahli waris dari negara asing, Shapuur, mengunjungi Zawame sebagai bagian dari perjalanannya. Kaito bertemu dengan Shapuur yang sangat mirip dengan dirinya. dan karena suatu alasan mereka bertukar tempat.